EFRR je súčasťou politiky súdržnosti EÚ a jeho cieľom je posilniť hospodársku, sociálnu a územnú súdržnosť v Európskej únii odstránením nerovnováh medzi jej regiónmi, podporou oživenia hospodárstva, vytvárania pracovných miest, konkurencieschopnosti, inovácií a udržateľnosti. Slúži na realizáciu politických priorít Únie, najmä zelenej a digitálnej transformácie.
V rámci EFRR programy Interreg podporujú cezhraničnú (Interreg A a IPA), nadnárodnú (Interreg B) a medziregionálnu (Interreg C) spoluprácu, ako aj spoluprácu najvzdialenejších regiónov (Interreg D).