Oikeudenmukaisen siirtymän mekanismilla parannetaan alueiden ja yksittäisten ihmisten valmiuksia kohdata sosiaalisia ja taloudellisia sekä työllisyyteen ja ympäristöön liittyviä haasteita, joita syntyy, kun EU toteuttaa Pariisin sopimuksen mukaisesti vuoteen 2030 ulottuvia energia- ja ilmastotavoitteitaan ja ilmastoneutraaliin talouteen siirtymistä vuoteen 2050 mennessä. Rahastosta myönnetään räätälöityä tukea, minkä takia sillä on tärkeä asema sellaisten alueiden tukemisessa, joihin ilmastoneutraaliuteen siirtyminen vaikuttaa eniten. Rahaston avulla tuetaan kyseisten alueiden talouden monipuolistamista ja uudistamista ja siten kevennetään ilmastosiirtymän sosioekonomisia kustannuksia. Keinoja ovat mm. pienten ja keskisuurten yritysten tuotannollisten investointien tukeminen, uusien yritysten perustaminen, panostukset tutkimukseen ja innovointiin, ympäristön ennallistaminen, puhtaan energian tukeminen ja työntekijöiden täydennys- ja uudelleenkoulutus.