EFRR jest częścią polityki spójności UE i ma na celu wzmocnienie spójności gospodarczej, społecznej i terytorialnej w Unii Europejskiej poprzez korygowanie nierówności między jej regionami, wspieranie ożywienia gospodarczego, tworzenia miejsc pracy, sprzyjanie konkurencyjności, innowacjom i zrównoważonemu rozwojowi. W ramach EFRR realizowane są priorytety polityczne Unii, zwłaszcza te dotyczące transformacji ekologicznej i cyfrowej.

Program INTERREG, finansowany z zasobów EFRR, wspiera współpracę transgraniczną (Interreg A i IPA), współpracę transnarodową (Interreg B), współpracę międzyregionalną (Interreg C) i współpracę regionów najbardziej oddalonych (Interreg D).

Fundusz Spójności jest również jednym z funduszy wdrażających unijną politykę spójności. Jest skierowany do państw członkowskich, których dochód narodowy brutto (DNB) na mieszkańca jest niższy niż 90 proc. średniej UE, i które wspierają projekty w dziedzinie transeuropejskiej sieci transportowej (TEN-T) i ochrony środowiska.

Ponieważ EFRR i Fundusz Spójności (FS) są zarządzane głównie w ramach zarządzania dzielonego, instytucjom zarządzającym i krajom partnerskim powierza się przydzielanie środków finansowych oraz ustanawianie systemu zarządzania i kontroli. Dzięki temu fundusz może być wdrażany w oparciu o uzgodnione programy (które są również opracowywane i wdrażane w ramach podejścia opartego na wielopoziomowym sprawowaniu rządów, zgodnie z zasadą partnerstwa).

W celu realizacji programów EFRR odpowiednie instytucje zarządzające ogłaszają zaproszenia do składania projektów dostosowane do konkretnych potrzeb. Więcej informacji na ten temat można znaleźć na stronie internetowej poszczególnych instytucji zarządzających.

Istnieje również specjalny instrument EFRR objęty zarządzaniem bezpośrednim, tzw. międzyregionalne inwestycje innowacyjne (I3).

Szczegółowe przepisy prawne określono w rozporządzeniu w sprawie Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego i Funduszu Spójności oraz w rozporządzeniu w sprawie Europejskiej współpracy terytorialnej.